南科大已建立一支国际化高水平的教师队伍。截至目前，南方科技大学已签约引进教师1409人，包括院士64人（签约引进与自主培养全职院士48人），国际会士68人， 教育部特聘教授（含青年）46人，“国家特支计划”专家25人、“国家自然科学基金杰出青年基金”获得者56人、“国家自然科学基金优秀青年基金”获得者34人。教学科研系列教师90%以上具有海外工作经验，60%以上具有在世界排名前100名大学工作或学习的经历，高层次人才占教研系列50%以上。

南科大借鉴世界一流理工科大学的学科设置和办学模式，以理、工、医为主，兼具商科及特色人文社会学科，在本科、硕士、博士层次办学，在一系列新的学科方向上开展研究，使学校成为引领社会发展的思想库和新知识、新技术的源泉。

南科大现有8个二级学院，设置数学系、物理系、化学系、生物系、地球与空间科学系、统计与数据科学系、电子与电气工程系、材料科学与工程系、海洋科学与工程系、计算机科学与工程系、环境科学与工程学院、力学与航空航天工程系、机械与能源工程系、生物医学工程系、系统设计与智能制造学院、深港微电子学院、金融系、信息系统与管理工程系等33个院系及若干中心，开设35个本科招生专业。

2018年，南科大入选博士学位授权单位及硕士学位授权单位。截至目前，南科大获批数学、物理学、化学、地球物理学、生物学、力学、材料科学与工程、电子科学与技术等15个硕士学位授权一级学科及工程硕士专业学位授权点，获批数学、物理学、化学、地球物理学、生物学、力学、材料科学与工程7个博士学位授权点。建校至今，南科大实现了办学层次从学士、硕士到博士的提升，快速形成完整的本硕博人才培养体系，创造了中国高等教育发展史上的“新深圳速度”。

截至2024年1月，南科大在校生总数11000余人，其中本科生5000余人，硕士、博士研究生6200余人。

南科大致力于培养拔尖创新人才。人才培养的具体措施是以学分制、导师制和书院制为基础，依托“631”招生体系、课程体系、科研体系、创新实训体系、“2+2”或“1+3”通识-专业融合式培养体系、国际化三学期体系（“六体系”），实施个性化、精英化和国际化拔尖创新人才培养。

南科大本科教育的核心是“以学生成长成才为中心”，提倡启发式教学、互动式教学，注重对学生自我学习能力和科研实践能力的培养，鼓励学术创造与创新。